Sous la corniche horizontale, décorée de reliefs représentant des scènes de chasse, des dragons, des protomes humains et animaux, se trouvent trois fenêtres, une fenêtre à triple lancette au centre et deux fenêtres à meneaux de chaque côté. La fenêtre à triple lancette est soutenue par des colonnes jumelles en marbre de récupération et est richement décorée de motifs végétaux ; les fenêtres à meneaux reposent sur des colonnes torsadées dont les bases sont constituées de chapiteaux inversés.
Au fond, le beau portail en retrait est décoré de sarments de vigne et d’animaux de combat.
L’intérieur de l’église, simple et sévère mais en même temps monumental, comporte une nef et deux collatéraux construits sur des colonnes trapues. Il convient de noter la toiture à demi-croupe des deux nefs latérales, un motif rare dans les édifices religieux de l’Ombrie.
Au fond de la nef, le presbytère est nettement surélevé par rapport à la crypte, qui est écartée et mystique, une salle unique avec deux colonnes soutenant les voûtes d’arêtes.
Curiosités
La ville de Bevagna et l’église de San Silvestro ont servi de décor au troisième film de Liliana Cavani sur saint François.